Parallel pipelines for dna sequence alignment on a cluster of multicores : (Record no. 55880)
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000 -CABECERA | |
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campo de control de longitud fija | 01812naa a2200265 a 4500 |
003 - IDENTIFICADOR DEL NÚMERO DE CONTROL | |
campo de control | AR-LpUFIB |
005 - FECHA Y HORA DE LA ÚLTIMA TRANSACCIÓN | |
campo de control | 20250311170421.0 |
008 - DATOS DE LONGITUD FIJA--INFORMACIÓN GENERAL | |
campo de control de longitud fija | 230201s2012 xx o 000 0 eng d |
024 8# - Otro identificador estandar | |
Número estándar o código | DIF-M6685 |
-- | 6822 |
-- | DIF006098 |
040 ## - FUENTE DE LA CATALOGACIÓN | |
Centro catalogador/agencia de origen | AR-LpUFIB |
Lengua de catalogación | spa |
Centro/agencia transcriptor | AR-LpUFIB |
100 1# - ENTRADA PRINCIPAL--NOMBRE DE PERSONA | |
Nombre de persona | Rucci, Enzo |
245 10 - MENCIÓN DE TÍTULO | |
Título | Parallel pipelines for dna sequence alignment on a cluster of multicores : |
Resto del título | a comparison of communication models |
300 ## - DESCRIPCIÓN FÍSICA | |
Extensión | 1 archivo (212,3 KB) |
500 ## - NOTA GENERAL | |
Nota general | Formato de archivo: PDF. -- Este documento es producción intelectual de la Facultad de Informática - UNLP (Colección BIPA/Biblioteca) |
520 ## - SUMARIO, ETC. | |
Sumario, etc. | HPC (high perfomance computing) based on clusters of multicores is one of the main research lines in parallel programming. It is important to study the impact of programming paradigms of shared memory, message passing or a combination of both on these architectures in order to efficiently exploit the power of these architectures. The Smith-Waterman algorithm is used as study case for the local alignment of DNA sequences, which allows establishing the similarity degree between two sequences. In this paper, the Smith-Waterman algorithm is parallelized by means of a pipeline scheme due to the data dependencies that are inherent to the problem, using the various communication/synchronization models mentioned above and then carrying out a comparative analysis. Finally, experimental results are presented, as well as future research lines. |
534 ## - NOTA SOBRE LA VERSIÓN ORIGINAL | |
Encabezamiento principal del original | Journal of Communication and Computer, 9 (12), pp. 1364-1371 |
650 #4 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA | |
Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada | CLUSTERS |
650 #4 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA | |
Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada | PROGRAMACIÓN PARALELA |
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA | |
Nombre de persona | Chichizola, Franco |
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA | |
Nombre de persona | Naiouf, Ricardo Marcelo |
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA | |
Nombre de persona | De Giusti, Laura Cristina |
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA | |
Nombre de persona | De Giusti, Armando Eduardo |
856 40 - LOCALIZACIÓN Y ACCESO ELECTRÓNICOS | |
Identificador Uniforme del Recurso | <a href="http://goo.gl/Z08xZ1">http://goo.gl/Z08xZ1</a> |
942 ## - ELEMENTOS DE PUNTO DE ACCESO ADICIONAL (KOHA) | |
Tipo de ítem Koha | Capítulo de libro |
Estado de retiro | Estado de pérdida | Estado dañado | Disponibilidad | Colección | Biblioteca permanente | Biblioteca actual | Fecha de adquisición | Total de préstamos | Signatura topográfica completa | Fecha visto por última vez | Identificador Uniforme del Recurso | Precio válido a partir de | Tipo de ítem Koha |
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No corresponde | Biblioteca digital | Biblioteca de la Facultad de Informática | Biblioteca de la Facultad de Informática | 11/03/2025 | A0430 | 11/03/2025 | http://catalogo.info.unlp.edu.ar/meran/getDocument.pl?id=710 | 11/03/2025 | Capítulo de libro |