Parallel pipelines for dna sequence alignment on a cluster of multicores : (Record no. 55880)

MARC details
000 -CABECERA
campo de control de longitud fija 01812naa a2200265 a 4500
003 - IDENTIFICADOR DEL NÚMERO DE CONTROL
campo de control AR-LpUFIB
005 - FECHA Y HORA DE LA ÚLTIMA TRANSACCIÓN
campo de control 20250311170421.0
008 - DATOS DE LONGITUD FIJA--INFORMACIÓN GENERAL
campo de control de longitud fija 230201s2012 xx o 000 0 eng d
024 8# - Otro identificador estandar
Número estándar o código DIF-M6685
-- 6822
-- DIF006098
040 ## - FUENTE DE LA CATALOGACIÓN
Centro catalogador/agencia de origen AR-LpUFIB
Lengua de catalogación spa
Centro/agencia transcriptor AR-LpUFIB
100 1# - ENTRADA PRINCIPAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Rucci, Enzo
245 10 - MENCIÓN DE TÍTULO
Título Parallel pipelines for dna sequence alignment on a cluster of multicores :
Resto del título a comparison of communication models
300 ## - DESCRIPCIÓN FÍSICA
Extensión 1 archivo (212,3 KB)
500 ## - NOTA GENERAL
Nota general Formato de archivo: PDF. -- Este documento es producción intelectual de la Facultad de Informática - UNLP (Colección BIPA/Biblioteca)
520 ## - SUMARIO, ETC.
Sumario, etc. HPC (high perfomance computing) based on clusters of multicores is one of the main research lines in parallel programming. It is important to study the impact of programming paradigms of shared memory, message passing or a combination of both on these architectures in order to efficiently exploit the power of these architectures. The Smith-Waterman algorithm is used as study case for the local alignment of DNA sequences, which allows establishing the similarity degree between two sequences. In this paper, the Smith-Waterman algorithm is parallelized by means of a pipeline scheme due to the data dependencies that are inherent to the problem, using the various communication/synchronization models mentioned above and then carrying out a comparative analysis. Finally, experimental results are presented, as well as future research lines.
534 ## - NOTA SOBRE LA VERSIÓN ORIGINAL
Encabezamiento principal del original Journal of Communication and Computer, 9 (12), pp. 1364-1371
650 #4 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA
Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada CLUSTERS
650 #4 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA
Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada PROGRAMACIÓN PARALELA
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Chichizola, Franco
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Naiouf, Ricardo Marcelo
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona De Giusti, Laura Cristina
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona De Giusti, Armando Eduardo
856 40 - LOCALIZACIÓN Y ACCESO ELECTRÓNICOS
Identificador Uniforme del Recurso <a href="http://goo.gl/Z08xZ1">http://goo.gl/Z08xZ1</a>
942 ## - ELEMENTOS DE PUNTO DE ACCESO ADICIONAL (KOHA)
Tipo de ítem Koha Capítulo de libro
Holdings
Estado de retiro Estado de pérdida Estado dañado Disponibilidad Colección Biblioteca permanente Biblioteca actual Fecha de adquisición Total de préstamos Signatura topográfica completa Fecha visto por última vez Identificador Uniforme del Recurso Precio válido a partir de Tipo de ítem Koha
      No corresponde Biblioteca digital Biblioteca de la Facultad de Informática Biblioteca de la Facultad de Informática 11/03/2025   A0430 11/03/2025 http://catalogo.info.unlp.edu.ar/meran/getDocument.pl?id=710 11/03/2025 Capítulo de libro